El Instituto de la Empresa Familiar quiso tener desde sus orígenes un ámbito nacional, que trasladó al conjunto del Estado mediante las Asociaciones Territoriales de Empresa Familiar, formadas por empresas familiares líderes en los distintos sectores de actividad de su región.

El principal objetivo de las Asociaciones Territoriales es el de ser referente institucional, social, económico y académico de la realidad de la empresa familiar en su Comunidad Autónoma.

La vinculación entre el Instituto y las Asociaciones Territoriales se realiza a través de un convenio de colaboración que incluye una identificación pública como "Asociación vinculada al Instituto de la Empresa Familiar". El IEF comparte con sus asociaciones objetivos y actividades encaminadas a la promoción de los valores y principios de las empresas familiares y su papel fundamental en la economía regional y nacional.

Actualmente, el IEF cuenta con 18 Asociaciones Territoriales de Empresa Familiar vinculadas, que cubren la totalidad de las comunidades autónomas españolas, y que están formadas por 2.000 empresas familiares líderes en los distintos sectores de actividad de su región.